Σκοπός του προγράμματος είναι η παροχή υψηλού επιπέδου μεταπτυχιακής εκπαίδευσης στα πεδία της  Εφαρμοσμένης Βιοπληροφορικής σε αντικείμενα της Μοριακής Βιολογίας και της Γενετικής, καθώς και της Ανάλυσης Δεδομένων που προκύπτουν από την έρευνα στα αντικείμενα αυτά σε διάφορους οργανισμούς. Ιδιαίτερη έμφαση δίνεται στην επεξεργασία, ανάλυση και ερμηνεία των δεδομένων που προκύπτουν με σύγχρονα εργαλεία όπως είναι η αλληλούχιση νέας γενιάς (NGS), καθώς επίσης και στην αξιοποίηση των πιο επίκαιρων τεχνολογιών που αναπτύσσει η επιστήμη της Πληροφορικής, όπως είναι οι γράφοι γνώσης, τα νευρωνικά δίκτυα, η μηχανική μάθηση και η βαθειά μάθηση.

Το πρόγραμμα απευθύνεται σε απόφοιτους σχολών και τμημάτων βιολογικής κατεύθυνσης (π.χ. Βιολογίας, Μοριακής Βιολογίας και Γενετικής, Επιστημών Ζωής, Ιατρικής, Φαρμακευτικής, Κτηνιατρικής, Γεωτεχνικών και Περιβαλλοντικών Επιστημών) καθώς επίσης και σε  απόφοιτους σχολών και τμημάτων του ευρύτερου χώρου της Πληροφορικής, των Μαθηματικών, των Πολυτεχνικών Σχολών και άλλων. Οι απόφοιτοι του Προγράμματος Μεταπτυχιακών Σπουδών “Εφαρμοσμένη Βιοπληροφορική – Ανάλυση Βιολογικών Δεδομένων” θα μπορούν να σταδιοδρομήσουν στον ανερχόμενο επαγγελματικό τομέα της ανάλυσης βιολογικών δεδομένων όπου υπάρχει αυξημένη ανάγκη διεπιστημονικότητας καθώς και να απασχοληθούν σε ακαδημαϊκά και ερευνητικά Ιδρύματα, σε κέντρα βιοϊατρικής και διαγνωστικής, σε περιβαλλοντικά εργαστήρια και φορείς καθώς και σε βιοτεχνολογικές και φαρμακευτικές εταιρείες. Επιπλέον, το πρόγραμμα αυτό θα είναι ιδιαίτερα χρήσιμο σε όσες και όσους επιθυμούν να ακολουθήσουν ακαδημαϊκή πορεία μέσα από την εκπόνηση διδακτορικής διατριβής, καθώς θα βοηθήσει στην ανάπτυξη της κριτικής, αναλυτικής και συνθετικής τους ικανότητας, καθώς και της ικανότητας συγγραφής επιστημονικών κειμένων.